MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis K-10

Total Repeats: 127469

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002944	AGA	2	6	41546	41551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41406133
1002	NC_002944	CGGGCT	2	12	41559	41570	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	41406133
1003	NC_002944	GCC	2	6	41571	41576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406133
1004	NC_002944	TGG	2	6	41597	41602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406133
1005	NC_002944	CCG	2	6	41603	41608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406133
1006	NC_002944	CGG	2	6	41648	41653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406133
1007	NC_002944	CGGCG	2	10	41663	41672	0 %	0 %	60 %	40 %	41406133
1008	NC_002944	ACCGG	2	10	41674	41683	20 %	0 %	40 %	40 %	41406133
1009	NC_002944	TGG	2	6	41684	41689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406133
1010	NC_002944	ATCG	2	8	41761	41768	25 %	25 %	25 %	25 %	41406133
1011	NC_002944	ACA	2	6	41779	41784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406133
1012	NC_002944	TCTG	2	8	41808	41815	0 %	50 %	25 %	25 %	41406133
1013	NC_002944	GCT	2	6	41841	41846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406133
1014	NC_002944	CGC	2	6	41847	41852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406133
1015	NC_002944	GGC	2	6	41897	41902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406133
1016	NC_002944	CCA	2	6	41960	41965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406133
1017	NC_002944	GC	4	8	41972	41979	0 %	0 %	50 %	50 %	41406133
1018	NC_002944	GTC	2	6	42000	42005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406133
1019	NC_002944	CAT	2	6	42018	42023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406133
1020	NC_002944	CGA	2	6	42048	42053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406133
1021	NC_002944	G	6	6	42074	42079	0 %	0 %	100 %	0 %	41406133
1022	NC_002944	GTGC	2	8	42106	42113	0 %	25 %	50 %	25 %	41406133
1023	NC_002944	CGA	3	9	42162	42170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406133
1024	NC_002944	TCA	2	6	42215	42220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41406134
1025	NC_002944	CGG	2	6	42230	42235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406134
1026	NC_002944	CGG	2	6	42323	42328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406134
1027	NC_002944	GCA	2	6	42344	42349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406134
1028	NC_002944	CGC	2	6	42386	42391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406134
1029	NC_002944	GACC	2	8	42395	42402	25 %	0 %	25 %	50 %	41406134
1030	NC_002944	GC	3	6	42412	42417	0 %	0 %	50 %	50 %	41406134
1031	NC_002944	GCCG	2	8	42465	42472	0 %	0 %	50 %	50 %	41406134
1032	NC_002944	CGC	2	6	42479	42484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406134
1033	NC_002944	CGA	2	6	42490	42495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406134
1034	NC_002944	GCG	2	6	42521	42526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406134
1035	NC_002944	GTG	2	6	42561	42566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406134
1036	NC_002944	CGG	2	6	42568	42573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406134
1037	NC_002944	ACC	2	6	42589	42594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406134
1038	NC_002944	GCT	2	6	42602	42607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406134
1039	NC_002944	GGCC	2	8	42644	42651	0 %	0 %	50 %	50 %	41406134
1040	NC_002944	CGGGC	2	10	42656	42665	0 %	0 %	60 %	40 %	41406134
1041	NC_002944	CG	3	6	42672	42677	0 %	0 %	50 %	50 %	41406134
1042	NC_002944	GCC	2	6	42712	42717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406134
1043	NC_002944	G	6	6	42727	42732	0 %	0 %	100 %	0 %	41406134
1044	NC_002944	CAC	2	6	42809	42814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406134
1045	NC_002944	CAA	2	6	42914	42919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406134
1046	NC_002944	TCG	3	9	42922	42930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406134
1047	NC_002944	CAA	2	6	42974	42979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406134
1048	NC_002944	CCGA	2	8	42992	42999	25 %	0 %	25 %	50 %	41406134
1049	NC_002944	AAC	2	6	43060	43065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41406135
1050	NC_002944	GCG	2	6	43094	43099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406135
1051	NC_002944	CGGCG	2	10	43121	43130	0 %	0 %	60 %	40 %	41406135
1052	NC_002944	CGG	2	6	43177	43182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406135
1053	NC_002944	CGG	2	6	43197	43202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406135
1054	NC_002944	CGC	2	6	43267	43272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406135
1055	NC_002944	GC	3	6	43276	43281	0 %	0 %	50 %	50 %	41406135
1056	NC_002944	AGC	2	6	43309	43314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406135
1057	NC_002944	GGT	2	6	43328	43333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406135
1058	NC_002944	ACG	2	6	43541	43546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406136
1059	NC_002944	GCCG	2	8	43617	43624	0 %	0 %	50 %	50 %	41406136
1060	NC_002944	CGG	2	6	43631	43636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406136
1061	NC_002944	CCG	2	6	43689	43694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406136
1062	NC_002944	GCA	2	6	43695	43700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406136
1063	NC_002944	CCG	2	6	43745	43750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406136
1064	NC_002944	GCG	2	6	43783	43788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406136
1065	NC_002944	CAG	2	6	43825	43830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406136
1066	NC_002944	GCA	2	6	43926	43931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406136
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1068	NC_002944	CGG	2	6	43976	43981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406136
1069	NC_002944	GC	3	6	43984	43989	0 %	0 %	50 %	50 %	41406136
1070	NC_002944	GGT	2	6	44034	44039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41406136
1071	NC_002944	GAC	2	6	44056	44061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406136
1072	NC_002944	ACG	2	6	44102	44107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406136
1073	NC_002944	CGT	2	6	44138	44143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406136
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1078	NC_002944	CGA	3	9	44244	44252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406136
1079	NC_002944	CGAT	2	8	44261	44268	25 %	25 %	25 %	25 %	41406136
1080	NC_002944	GCC	2	6	44275	44280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406136
1081	NC_002944	GGC	2	6	44293	44298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406136
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1084	NC_002944	CGG	2	6	44415	44420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406136
1085	NC_002944	CGA	3	9	44550	44558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406136
1086	NC_002944	CGA	2	6	44571	44576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406136
1087	NC_002944	GCC	2	6	44577	44582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406136
1088	NC_002944	GGCCG	2	10	44583	44592	0 %	0 %	60 %	40 %	41406136
1089	NC_002944	GGC	3	9	44646	44654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406136
1090	NC_002944	GCC	2	6	44662	44667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406136
1091	NC_002944	CGG	2	6	44670	44675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406136
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1093	NC_002944	CGG	2	6	44732	44737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406136
1094	NC_002944	CGGGC	2	10	44868	44877	0 %	0 %	60 %	40 %	41406136
1095	NC_002944	CGG	3	9	44900	44908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406136
1096	NC_002944	CACCGA	2	12	44942	44953	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	41406136
1097	NC_002944	CGGC	2	8	44956	44963	0 %	0 %	50 %	50 %	41406136
1098	NC_002944	TCG	2	6	44968	44973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406136
1099	NC_002944	ACC	2	6	44974	44979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41406136
1100	NC_002944	CCGTC	2	10	45115	45124	0 %	20 %	20 %	60 %	41406137
1101	NC_002944	CGC	2	6	45131	45136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406137
1102	NC_002944	GCCG	2	8	45189	45196	0 %	0 %	50 %	50 %	41406137
1103	NC_002944	GCG	2	6	45212	45217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406137
1104	NC_002944	AGC	2	6	45229	45234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406137
1105	NC_002944	GCT	2	6	45237	45242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406137
1106	NC_002944	CGG	2	6	45277	45282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406137
1107	NC_002944	AGC	2	6	45292	45297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406137
1108	NC_002944	AGG	2	6	45304	45309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406137
1109	NC_002944	GCA	2	6	45325	45330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406137
1110	NC_002944	TCG	2	6	45331	45336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406137
1111	NC_002944	GACG	2	8	45349	45356	25 %	0 %	50 %	25 %	41406137
1112	NC_002944	GCG	3	9	45411	45419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406138
1113	NC_002944	CTG	2	6	45491	45496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406138
1114	NC_002944	CCG	2	6	45498	45503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406138
1115	NC_002944	CGA	2	6	45538	45543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406138
1116	NC_002944	TCG	2	6	45546	45551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406138
1117	NC_002944	CCG	2	6	45552	45557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406138
1118	NC_002944	CA	3	6	45560	45565	50 %	0 %	0 %	50 %	41406138
1119	NC_002944	CGG	2	6	45570	45575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406138
1120	NC_002944	CG	3	6	45588	45593	0 %	0 %	50 %	50 %	41406138
1121	NC_002944	GCC	2	6	45636	45641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406138
1122	NC_002944	GCAC	2	8	45642	45649	25 %	0 %	25 %	50 %	41406138
1123	NC_002944	TCGG	2	8	45928	45935	0 %	25 %	50 %	25 %	41406139
1124	NC_002944	GC	3	6	46151	46156	0 %	0 %	50 %	50 %	41406139
1125	NC_002944	GTGCG	2	10	46219	46228	0 %	20 %	60 %	20 %	41406139
1126	NC_002944	CGA	2	6	46240	46245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41406139
1127	NC_002944	GCG	2	6	46270	46275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41406139
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1249	NC_002944	CG	3	6	50027	50032	0 %	0 %	50 %	50 %	41406142
1250	NC_002944	GCC	3	9	50219	50227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406143
1251	NC_002944	GGA	2	6	50228	50233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41406143
1252	NC_002944	CGC	2	6	50255	50260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41406143
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1254	NC_002944	TGC	2	6	50284	50289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41406143
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